Окончил ЛГИТМиК в 1996 г. (курс В. Фильштинского). В 1995-1996 г.г. работал в Экспериментальном театре «Перекресток», а также ведущим на региональном телевидении в отделе музыкальных и информационных программ.
В 1996 г. работал в московском театре «Сатирикон», где играл в спектаклях «Трехгрошовая опера» и «Сирано де Бержерак».
В том же году вернулся в Санкт-Петербург и вступил в труппу театра имени Ленсовета, где играл главные роли в спектаклях режиссёра Ю. Бутусова: Эстрагон в «В ожидании Годо» С. Беккета, Дурачок Карл в «Войцеке» Г. Бюхнера, Калигула в «Калигуле» А. Камю. Играл в спектаклях В. Пази: «Король, дама, валет» В. Набокова (Манекен, Официант, Санитар), «Братец Кролик на Диком Западе» Э. Гайдая (Братец Опоссум), «Поживем — увидим» Б. Шоу (Валентайн). В антрепризном спектакле «Смерть Тарелкина» по пьесе А. Сухово-Кобылина играл Варравина (реж. Ю. Бутусов).
На сцене Московского Художественного театра дебютировал в 2002 году в роли Зилова в «Утиной охоте» А. Вампилова (реж. А. Марин).
В 2003 году был принят в труппу МХТ. Среди актёрских работ в Художественном театре: Алексей Турбин в «Белой гвардии» М. Булгакова (реж. С. Женовач, 2004), Клавдий в «Гамлете» В. Шекспира (реж. Ю. Бутусов, 2005). Мэкки Нож в «Трёхгрошовой опере» Б. Брехта (реж. К. Серебренников, 2009), Контрабасист в «Контрабасе» П. Зюскинда (реж. Г. Черепанов, 2014), Мюнхгаузен в спектакле «Враки, или Завещание барона Мюнхгаузена» (пьеса написана К. Хабенским в соавторстве с режиссёром В. Крамером; 2021), Каренин в «Серёже» по роману Л. Н. Толстого «Анна Каренина» (ввод 2022 г.), Володя в спектакле «9 ряд. 10, 11 место» Ю. Поспеловой (реж. Д. Азаров, 2023).
В Театре п/р О. Табакова играл Тригорина в чеховской «Чайке» (реж. К. Богомолов, 2011).
С 2016 года на протяжении шести лет в театре «Современник» играл главную роль в спектакле «Не покидай свою планету» по повести А. де Сент-Экзюпери «Маленький принц» (реж. В. Крамер), в 2022 году спектакль был перенесён на сцену МХТ имени А. П. Чехова. В том же 2022 году поставил в «Современнике» спектакль «Интуиция» по пьесе А. Цыпкина.
В содружестве с Юрием Башметом и камерным ансамблем «Солисты Москвы» создал литературно-музыкальную программу на основе пьесы «Калигула» А. Камю и квартета «Смерть и Девушка» Ф. Шуберта и Г. Малера. Как чтец, вместе с солистами Мариинского театра и государственным симфоническим оркестром «Новая Россия», принимает участие в «Евгении Онегине» — авторской версии Ю. Башмета по мотивам романа А. С. Пушкина и оперы П. И. Чайковского.
В 2008 г. учредил собственный благотворительный фонд, который занимается организацией помощи детям с онкологическими и другими тяжёлыми заболеваниями головного мозга. В 2010 году начал реализацию проекта «Студии творческого развития благотворительного фонда Константина Хабенского»: в Москве, Санкт-Петербурге, Екатеринбурге, Казани, Перми, Уфе, Нижнем Тагиле, Новосибирске, Воронеже, Перми, Тольятти, Сочи, Нижнем Новгороде и Иваново на базе общеобразовательных школ были открыты детские творческие студии. Продолжением этого проекта стал фестиваль «Оперение» и благотворительный театральный проект «Поколение Маугли» (в 2014 году проект был удостоен Премии Станиславского, в 2022-м вошёл в репертуар Московского Художественного театра).
В 2019 году удостоен Государственной премии РФ за выдающиеся достижения в области благотворительной деятельности.
28 октября 2021 года возглавил Московский Художественный театр имени А. П. Чехова.
В октябре 2024 года вошёл в состав Совета по культуре и искусству при Президенте Российской Федерации.
Лауреат театральных премий: независимой актёрской премии имени В. И. Стржельчика за актёрский ансамбль в спектакле «В ожидании Годо» (1999 г.); театральной премии «Чайка» (роль Клавдия в спектакле МХТ «Гамлет», номинация «Лучший исполнитель отрицательной роли», 2005 г.); международной премии имени К. С. Станиславского (за театральные работы в спектаклях МХТ «Утиная охота», «Белая гвардия», «Гамлет»; 2007 г.); премии Олега Табакова — «За остросовременную, талантливую, интерпретацию шекспировского Клавдия в спектакле МХТ Гамлет» (2006) и «За победу над стереотипами и придание образу Тригорина живого человеческого чувства» («Чайка», Театр п/р О. Табакова, 2012); театральной премии газеты «Московский комсомолец» за исполнение главной роли в спектакле МХТ «Контрабас» (2014).
Лауреат кинематографических премий и фестивалей: премии Гатчинского кинофестиваля «Литература и кино» в номинации «Лучшая мужская роль» (роль Андрея в фильме «Женская собственность», 2000 г.); фестиваля «Виват кино России!» (приз «Лучшая мужская роль» за роль Саши Гурьева в фильме «В движении», 2003 г.; спецприз жюри «Лучшая роль года» за роль Виктора Служкина в фильме «Географ глобус пропил», 2014 г.); премии российской кинопрессы «Золотой овен» (за роль Эдика в фильме «Бедные родственники», 2006 г.); кинопремии «Золотой орёл» (роль Грина в фильме «Статский советник», номинация «Лучшая роль второго плана», 2006 г.; роль Александра Колчака в фильме «Адмиралъ», номинация «Лучшая мужская роль», 2008 г.; роль Виктора Служкина в фильме «Географ глобус пропил», номинация «Лучшая мужская роль», 2014 г.); обладатель приза фестиваля «Кинотавр» за лучшую мужскую роль (роль Эдика в фильме «Бедные родственники», 2005 г.; роль Виктора Служкина в фильме «Географ глобус пропил», 2013 г.; роль Артура в фильме «Коллектор», 2016 г.); кинопремии «Ника» (роль Виктора Служкина в фильме «Географ глобус пропил», номинация «Лучшая мужская роль», 2014 г.); премии Ассоциации продюсеров кино и телевидения в номинации «Лучший актёр года» (роль Родиона Меглина в телесериале «Метод», 2016); телевизионной премии ТЭФИ (роль Родиона Меглина в телесериале «Метод», номинация «Лучший актёр телевизионного фильма/сериала», 2016 г.), почётной премии «Верю. Константин Станиславский» 44-го Московского Международного кинофестиваля — «за покорение вершин актерского мастерства и верность принципам школы К. С. Станиславского» (2022 г.).
Лауреат Премии Владимира Высоцкого «Своя колея» — «За высочайший профессионализм и подвижничество, за многолетнее служение добру и красоте, за помощь тяжелобольным детям» (2023 г.). В 2023 году награждён орденом Почёта за вклад в развитие отечественной культуры и искусства и многолетнюю плодотворную деятельность. В 2023 и 2024 годах по опросам ВЦИОМ был признан лучшим актёром по мнению россиян. В 2024 году удостоен Премии города Москвы за большой вклад в развитие отечественного театрального искусства, организацию и проведение юбилейных мероприятий, посвященных основанию Московского Художественного театра, Музея МХАТ и Школы-студии МХАТ. Награжден ведомственной наградой Федерального казначейства — медалью «За Усердие и Пользу» (2024).